Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLK3P49761 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK3P49761 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK3P49761 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK3P49761 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK3P49761 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK3P49761 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK3P49761 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK3P49761 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK3P49761 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK3P49761 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK3P49761 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK3P49761 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK3P49761 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK3P49761 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK3P49761 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK3P49761 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK3P49761 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK3P49761 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK3P49761 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK3P49761 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK3P49761 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK3P49761 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK3P49761 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK3P49761 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK3P49761 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK3P49761 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK3P49761 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK3P49761 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK3P49761 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLK3P49761 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLK3P49761 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLK3P49761 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK3P49761 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK3P49761 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK3P49761 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK3P49761 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK3P49761 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.4 ms