Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX1P48742 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX1P48742 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX1P48742 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX1P48742 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX1P48742 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX1P48742 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX1P48742 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX1P48742 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX1P48742 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX1P48742 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX1P48742 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX1P48742 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LHX1P48742 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX1P48742 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX1P48742 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX1P48742 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX1P48742 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX1P48742 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX1P48742 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX1P48742 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX1P48742 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX1P48742 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX1P48742 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX1P48742 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX1P48742 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX1P48742 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX1P48742 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX1P48742 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX1P48742 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX1P48742 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX1P48742 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX1P48742 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX1P48742 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX1P48742 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX1P48742 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX1P48742 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX1P48742 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX1P48742 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX1P48742 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX1P48742 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX1P48742 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX1P48742 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms