Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA2P48052 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA2P48052 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA2P48052 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA2P48052 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA2P48052 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA2P48052 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA2P48052 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA2P48052 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA2P48052 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA2P48052 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA2P48052 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA2P48052 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA2P48052 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA2P48052 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA2P48052 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA2P48052 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA2P48052 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA2P48052 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA2P48052 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA2P48052 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA2P48052 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA2P48052 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA2P48052 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA2P48052 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms