Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPL28P46779 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPL28P46779 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPL28P46779 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPL28P46779 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPL28P46779 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPL28P46779 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPL28P46779 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPL28P46779 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPL28P46779 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RPL28P46779 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPL28P46779 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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