Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGFRP43088 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms