Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC19A1P41440 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC19A1P41440 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms