Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTRLP40313 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTRLP40313 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTRLP40313 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTRLP40313 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTRLP40313 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTRLP40313 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTRLP40313 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CTRLP40313 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTRLP40313 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTRLP40313 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTRLP40313 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTRLP40313 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms