Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FDFT1P37268 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms