Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF1P36956 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms