Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL4P36578 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL4P36578 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL4P36578 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL4P36578 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL4P36578 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL4P36578 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL4P36578 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL4P36578 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL4P36578 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL4P36578 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL4P36578 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL4P36578 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL4P36578 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL4P36578 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL4P36578 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms