Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT20P35900 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT20P35900 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT20P35900 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT20P35900 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT20P35900 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT20P35900 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT20P35900 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT20P35900 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT20P35900 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT20P35900 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT20P35900 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT20P35900 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT20P35900 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT20P35900 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT20P35900 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT20P35900 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT20P35900 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT20P35900 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT20P35900 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT20P35900 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT20P35900 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms