Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDXP35241 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDXP35241 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDXP35241 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDXP35241 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDXP35241 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDXP35241 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDXP35241 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDXP35241 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDXP35241 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDXP35241 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDXP35241 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDXP35241 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDXP35241 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDXP35241 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDXP35241 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDXP35241 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDXP35241 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDXP35241 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDXP35241 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDXP35241 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDXP35241 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDXP35241 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDXP35241 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDXP35241 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDXP35241 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDXP35241 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RDXP35241 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms