Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms