Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNB1P35222 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms