Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSP1P33241 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSP1P33241 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSP1P33241 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSP1P33241 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSP1P33241 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSP1P33241 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSP1P33241 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSP1P33241 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSP1P33241 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSP1P33241 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSP1P33241 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSP1P33241 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSP1P33241 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSP1P33241 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSP1P33241 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSP1P33241 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSP1P33241 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSP1P33241 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSP1P33241 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSP1P33241 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSP1P33241 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSP1P33241 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LSP1P33241 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSP1P33241 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSP1P33241 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSP1P33241 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSP1P33241 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSP1P33241 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSP1P33241 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSP1P33241 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSP1P33241 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSP1P33241 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSP1P33241 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSP1P33241 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSP1P33241 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSP1P33241 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms