Protein–RNA interactions for Protein: P31431

SDC4, Syndecan-4, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC4P31431 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC4P31431 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC4P31431 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDC4P31431 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDC4P31431 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDC4P31431 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDC4P31431 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC4P31431 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC4P31431 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC4P31431 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC4P31431 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC4P31431 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC4P31431 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC4P31431 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDC4P31431 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms