Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSPOP30536 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPOP30536 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPOP30536 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPOP30536 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPOP30536 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPOP30536 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSPOP30536 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSPOP30536 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSPOP30536 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSPOP30536 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSPOP30536 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSPOP30536 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSPOP30536 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms