Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CRABP1P29762 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRABP1P29762 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms