Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB2P29033 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB2P29033 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB2P29033 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB2P29033 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB2P29033 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB2P29033 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB2P29033 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB2P29033 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB2P29033 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB2P29033 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB2P29033 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB2P29033 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB2P29033 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB2P29033 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB2P29033 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB2P29033 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB2P29033 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB2P29033 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB2P29033 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GJB2P29033 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB2P29033 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB2P29033 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB2P29033 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB2P29033 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB2P29033 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB2P29033 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB2P29033 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB2P29033 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB2P29033 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB2P29033 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB2P29033 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB2P29033 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB2P29033 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB2P29033 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB2P29033 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB2P29033 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB2P29033 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB2P29033 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB2P29033 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB2P29033 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB2P29033 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB2P29033 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB2P29033 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB2P29033 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms