Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms