Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX2P28328 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX2P28328 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX2P28328 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX2P28328 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX2P28328 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX2P28328 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX2P28328 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX2P28328 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX2P28328 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX2P28328 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX2P28328 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX2P28328 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX2P28328 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX2P28328 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX2P28328 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX2P28328 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX2P28328 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX2P28328 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX2P28328 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX2P28328 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX2P28328 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX2P28328 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX2P28328 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX2P28328 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms