Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLDCP23378 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLDCP23378 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLDCP23378 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLDCP23378 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLDCP23378 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLDCP23378 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLDCP23378 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLDCP23378 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLDCP23378 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLDCP23378 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLDCP23378 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLDCP23378 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GLDCP23378 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLDCP23378 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLDCP23378 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLDCP23378 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLDCP23378 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLDCP23378 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GLDCP23378 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLDCP23378 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLDCP23378 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLDCP23378 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms