Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BGNP21810 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BGNP21810 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BGNP21810 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BGNP21810 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BGNP21810 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BGNP21810 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BGNP21810 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BGNP21810 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BGNP21810 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BGNP21810 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BGNP21810 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BGNP21810 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms