Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB4P21439 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms