Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFKB1P19838 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms