Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFEBP19484 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFEBP19484 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFEBP19484 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFEBP19484 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFEBP19484 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFEBP19484 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFEBP19484 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TFEBP19484 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFEBP19484 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFEBP19484 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFEBP19484 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFEBP19484 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFEBP19484 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFEBP19484 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFEBP19484 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFEBP19484 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFEBP19484 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFEBP19484 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFEBP19484 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFEBP19484 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TFEBP19484 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFEBP19484 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms