Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHCEP18577 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHCEP18577 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHCEP18577 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHCEP18577 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHCEP18577 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHCEP18577 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHCEP18577 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RHCEP18577 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RHCEP18577 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RHCEP18577 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHCEP18577 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHCEP18577 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHCEP18577 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHCEP18577 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHCEP18577 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHCEP18577 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHCEP18577 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHCEP18577 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHCEP18577 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHCEP18577 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms