Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB4P16144 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB4P16144 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms