Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP2P16035 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP2P16035 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms