Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRF1P14222 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRF1P14222 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRF1P14222 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRF1P14222 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRF1P14222 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRF1P14222 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRF1P14222 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRF1P14222 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PRF1P14222 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRF1P14222 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRF1P14222 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRF1P14222 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRF1P14222 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRF1P14222 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRF1P14222 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRF1P14222 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRF1P14222 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRF1P14222 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRF1P14222 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRF1P14222 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms