Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN1P12814 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTN1P12814 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN1P12814 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms