Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB1P12018 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms