Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MS4A1P11836 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MS4A1P11836 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MS4A1P11836 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms