Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNAT1P11488 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GNAT1P11488 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNAT1P11488 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms