Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUP10909 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUP10909 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUP10909 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUP10909 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUP10909 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUP10909 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUP10909 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUP10909 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLUP10909 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLUP10909 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUP10909 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUP10909 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUP10909 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUP10909 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUP10909 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUP10909 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUP10909 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUP10909 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUP10909 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUP10909 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUP10909 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms