Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP10827 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP10827 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP10827 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
THRAP10827 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THRAP10827 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP10827 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP10827 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP10827 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP10827 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP10827 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP10827 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP10827 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP10827 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP10827 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP10827 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP10827 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP10827 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP10827 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP10827 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP10827 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
THRAP10827 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THRAP10827 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THRAP10827 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THRAP10827 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRAP10827 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRAP10827 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THRAP10827 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms