Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
VSIG10L2P0DP72 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSIG10L2P0DP72 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms