Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC192P0DO97 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms