Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBBP0CG47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBBP0CG47 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBBP0CG47 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms