Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP3A4P08684 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CYP3A4P08684 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP3A4P08684 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms