Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI1P08151 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI1P08151 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI1P08151 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI1P08151 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI1P08151 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI1P08151 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI1P08151 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI1P08151 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI1P08151 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI1P08151 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms