Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPLP06858 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPLP06858 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPLP06858 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LPLP06858 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPLP06858 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPLP06858 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPLP06858 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPLP06858 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPLP06858 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPLP06858 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPLP06858 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPLP06858 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPLP06858 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPLP06858 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPLP06858 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPLP06858 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPLP06858 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPLP06858 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPLP06858 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPLP06858 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPLP06858 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPLP06858 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPLP06858 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPLP06858 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms