Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALB1P05937 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALB1P05937 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALB1P05937 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALB1P05937 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALB1P05937 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALB1P05937 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALB1P05937 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALB1P05937 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALB1P05937 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALB1P05937 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALB1P05937 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALB1P05937 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALB1P05937 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALB1P05937 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALB1P05937 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALB1P05937 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALB1P05937 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALB1P05937 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALB1P05937 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALB1P05937 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALB1P05937 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms