Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GYPCP04921 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GYPCP04921 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GYPCP04921 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GYPCP04921 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GYPCP04921 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GYPCP04921 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPCP04921 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPCP04921 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPCP04921 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPCP04921 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPCP04921 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPCP04921 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPCP04921 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPCP04921 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPCP04921 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GYPCP04921 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPCP04921 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GYPCP04921 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GYPCP04921 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GYPCP04921 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GYPCP04921 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GYPCP04921 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GYPCP04921 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GYPCP04921 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GYPCP04921 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GYPCP04921 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GYPCP04921 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GYPCP04921 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPCP04921 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GYPCP04921 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GYPCP04921 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GYPCP04921 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GYPCP04921 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GYPCP04921 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GYPCP04921 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GYPCP04921 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GYPCP04921 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GYPCP04921 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GYPCP04921 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GYPCP04921 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GYPCP04921 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GYPCP04921 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms