Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR4O95977 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms