Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN9O95484 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN9O95484 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms