Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGR4O95473 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms