Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX3O95343 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIX3O95343 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX3O95343 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX3O95343 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX3O95343 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX3O95343 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX3O95343 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX3O95343 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms