Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN3O95197 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN3O95197 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN3O95197 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN3O95197 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN3O95197 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN3O95197 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN3O95197 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN3O95197 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN3O95197 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN3O95197 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN3O95197 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN3O95197 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN3O95197 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN3O95197 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN3O95197 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN3O95197 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN3O95197 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN3O95197 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN3O95197 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN3O95197 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN3O95197 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN3O95197 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN3O95197 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN3O95197 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN3O95197 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN3O95197 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN3O95197 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN3O95197 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN3O95197 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN3O95197 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN3O95197 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN3O95197 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN3O95197 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN3O95197 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN3O95197 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN3O95197 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN3O95197 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN3O95197 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN3O95197 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN3O95197 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN3O95197 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN3O95197 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN3O95197 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN3O95197 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN3O95197 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN3O95197 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN3O95197 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN3O95197 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN3O95197 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN3O95197 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN3O95197 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN3O95197 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN3O95197 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN3O95197 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms