Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAF4O95104 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAF4O95104 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms